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Number of sequences: 9
Alignment assumed to be: DNA
New number of positions: 1353 (selected positions are underlined in blue)
10 20 30 40 50 60
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca -----------------------------------------------------------C
Anolis_occultus ATGAGCCCCAATAATCTACTTAATAGTTTAATT-AGCTTATTTATANNNACAACACTAGT
Anolis_sheplani ATGAG-CCCAACCATCTACACAATTATTTTATCAAGCCTAGCAACCGGCACTATTATTAC
Anolis_cybotes ATGAG-CCCGACAATTTTTTCAATTATATTATCAAGCTTAGCAACAGGCACAATTATTAC
Anolis_olssoni ATGAA-CCCCACCATCTACATAATTATTTTATCAAGCCTAGCAACAGGAACAATTATTAC
Anolis_coelesti ATGAG-CCCATTAATTTTTTCAATCGTCCTGTCAAGCCTAGCAACAGGTACTATTATTAC
Anolis_cristate ATGAG-CCCYACAATCTACACAATTATTTTGTCAAGCCTAGCAACAGGCACTATCATCAC
Anolis_evermann ATGAG-CCCTACAATCTATACAATTATTTTGTCAAGCCTAGCAACAGGCACAATCATTAC
Anolis_pulchell ATGAG-CCCCCAAATCTATACAATTATTTTATCAAGCTTAGCAGCAGGCACTATTATTAC
#
70 80 90 100 110 120
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca TGCAACCAGCTACCACTGATTAATAGCCTGAATTGGGCTAGAACTAAACACACTAGCCAT
Anolis_occultus AACCACTAGCCACCACTGATTATTAGCGTGAGTTGGCTTGGAAATTAACACACTTGCAGC
Anolis_sheplani AATATCTAGTTATCACTGACTAATGGCCTGAATCGGCCTAGAGATTAATACACTAGCAAT
Anolis_cybotes CATAACAAGCCATCACTGACTAATAGCCTGAATCGGATTAGAAATTAACACCTTAGCAAT
Anolis_olssoni TATGACCAGCTTTCATTGATTAATAGCATGAATTGGATTAGAAGTCAACACACTAGCAAT
Anolis_coelesti CATAACCAGCTATCACTGATTAATAGCTTGAATTGGCCTAGAAATCAACACACTTGCTAT
Anolis_cristate TATAACTAGCTTCCACTGACTAATGGCCTGAATCGGACTAGAGCTTAATACGCTAGCAAT
Anolis_evermann CATGACTAGCTTTCACTGACTTATAGCCTGAATTGGCCTAGAACTCAATACTCTGGCAAT
Anolis_pulchell CATAACAAGTTTTCACTGATTAATAGCCTGAATTGGACTTGAACTTAACTCATTAGCAAT
############################################################
130 140 150 160 170 180
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca CATTCCGATTATCTCAAAACGACACCACCCGCGAGCGACAGAGGCCGCAACTAAATACTT
Anolis_occultus TATTCCACTTATCTCAACAAAACATCACCCCCGAGCTACAGAATCAGCCACAAAATACTT
Anolis_sheplani AATCCCGATCATCTCAACAACACATCACCCACGATCTACAGAAGCAGCCACAAAATATTT
Anolis_cybotes TATTCCAATTATTTCAATACAGCATAGCCCACGAGCAACAGAAGCAGCCACAAAATATTT
Anolis_olssoni TATTCCAATCATCTCAGCCCCTCACCACCCACGATCAACAGAAGCTGCAACAAAATACTT
Anolis_coelesti CATTCCAATTATCTCAATACAACATCACCCACGATCTACAGAAGCCGCTACAAAATATTT
Anolis_cristate TATCCCGATTATTTCAACATTACACCACCCACGATCAACAGAAGCCGCAACAAAATACTT
Anolis_evermann TATTCCAATTATTTCATCACAACACCACCCTCGATCTACAGAAGCCGCAACAAAATACTT
Anolis_pulchell TATTCCAATTATTTCAACACTACACCACCCTCGAGCCACAGAAGCTGCAACAAAATACTT
############################################################
190 200 210 220 230 240
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca CTTAACCCAAGCAGCCGCCTCGGCCCTAATCCTATTCTCAAGTACAATTAATGCCTGACA
Anolis_occultus TTTAATTCAAGCAGCAGCCTCAGCTACAATCTTATTTTCAAGTACCATTAATGCTTGACA
Anolis_sheplani TTTAATTCAAGCTGCAGCCTCCGCCCTAATTTTGTTCTCAAGTATAACTAACGCCTGATA
Anolis_cybotes CTTAACACAAGCAGCTGCATCCTCATTAATTTTATTTTCAAGCCTCATCAACGCCTGACA
Anolis_olssoni TCTCACACAAGCAGCTGCCTCCGCTATAATTCTATTTGCCAGTATAATTAACGCCTGACA
Anolis_coelesti CCTTACACAAGCGGCAGCCTCCGCTATAATTTTATTTGCCAGCACAACAAATGCTTGATA
Anolis_cristate CTTAACACAAGCAGCAGCCTCTGCAATAATTATGTTTTCTAGCATAATTAATGCCTGAAA
Anolis_evermann CTTAACACAAGCAGCAGCATCTGCTATAATTCTGTTTTCAAGCATAACCAATGCCTGATT
Anolis_pulchell CTCCACTCAAGCGGCAGCTTCAGCTATAATTTTATTTTCTAGCATAATTAATGCCTGATA
############################################################
250 260 270 280 290 300
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca CTCAGGAACCTGAGACATTACACAAACAACTAATAATATATCAAACATTCTACTAACAAC
Anolis_occultus CACAGGCTCATGAGACATTACCCAAATAACCACAAACCCATCCAATATTTTACTAACTAT
Anolis_sheplani TACAGGCTCCTGGGACATTACCCAAATAGTAAACAAGCCCTCAAATATTGCACTAACAGT
Anolis_cybotes GACTGGCACATGAGATATTACTCAACTGTCAACCACCCAATCATGTATTCTCTTAACCAT
Anolis_olssoni AACAGGCACATGAGACATTACTCAACTGTCAACCACCCCTGCCCACACCCTCCTAACTAT
Anolis_coelesti CACAGGCACATGAGATATTACTCAAATTTCCGCCACCCCATCCCACATCCTTCTAACTGC
Anolis_cristate CATAGGAACATGGGACATTACTCAAATATCTTATACCCCATCAAATGTTCTTCTTTTACT
Anolis_evermann TACGGGCATATGAGATATTACTCAAATATCTTACACCCCATCTAATATCTTTTTAACCAT
Anolis_pulchell TACAGGAACATGAGATATTACTCACATATGTTACACCCCCTCTAATGTTATTTTAACCAT
############################################################
310 320 330 340 350 360
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AGCCTTAGCCATAAAACTAGGCCTAGCACCCACACACTTCTGACTACCAGAAGTCCTACA
Anolis_occultus AGCCCTTGCCATAAAACTAGGCCTAGCCCCAACACACTTCTGACTCCCAGAAGTACTTCA
Anolis_sheplani AGCACTGGCCATAAAACTAGGACTGGCCCCACTTCACTTTTGATTACCAGAGGTAGTTCA
Anolis_cybotes GGCACTATCAATAAAATTAGGCCTGGCCCCTCTACACTTTTGATTGCCAGAAGTAATTCA
Anolis_olssoni AGCACTAGCCATAAAACTAGGACTTGCCCCACTTCACTTCTGATTACCAGAAGTTATTCA
Anolis_coelesti CGCATTAGCCATAAAACTAGGCCTGGCCCCCATACACTTCTGATTACCAGAAGTCCTTCA
Anolis_cristate AGCACTGGCCCTAAAACTAGGACTAGCCCCAGCACACTTCTGACTCCCAGAGGTATTACA
Anolis_evermann AGCACTTGCTATAAAACTAGGCCTAGCCCCAACACACTTCTGATTTCCAGAAGTCCTACA
Anolis_pulchell AGCACTAGCCATAAAACTAGGACTTGCCCCAGCACACTTCTGACTCCCAGAAGTACTTCA
############################################################
370 380 390 400 410 420
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AGGGACCTCGATGATAACAGCCCTAATTATCAGCACCTGACAAAAACTAGCACCAATAGC
Anolis_occultus AGGGTCAACTATAGACACTGCCCTAATTATTACAACATGACAAAAAATTGCCCCAATAAC
Anolis_sheplani AGGATCAACCACAACCACAGCACTTATTATTATAACCTGACAAAAACTAGCCCCCATATC
Anolis_cybotes AGGAACAACAATACTTTCCGCCTTAATCATTATAACCTGACAAAAGCTAGCCCCCATATC
Anolis_olssoni AGGTGCCACCCTTCCCACTGCTTTCATCATTGTAACATGGCAAAAACTTGCTCCTATATC
Anolis_coelesti AGGGTCTACCTTAAAAACAAGCTTTATTATTGTAACATGACAAAAACTAGCCCCTATATC
Anolis_cristate GGGCTCAACCTTATTTATTGCCCTCATTATTACTACGTGGCAAAAACTGGCCCCAATGTC
Anolis_evermann AGGCTCAACCTTATTTACTGCTTTTGTTATTTCAACATGACAAAAACTGGCCCCAATATC
Anolis_pulchell AGGCTCAACCTTATTTACTGCCCTTATTATTTCTACCTGACAAAAACTAGCTCCAATATC
############################################################
430 440 450 460 470 480
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca CCTTATCGTACTAACAAACAATAACTTATCTTCAACCGTGCTGATAACAATAGGTATTTT
Anolis_occultus CCTAATTTACCTCACCATAAACAACCTATACCCAAGCATTCTAATAACAATAGGCCTATT
Anolis_sheplani ACTGATTTTTCTTACCATAAATAACTTATCTACAACAGCCCTTCTACTGATAGGACTTCT
Anolis_cybotes ATTAATTTATTTGACCTCAAACAATTTATCCACAACAACTCTTTTAATTCTGGGCCTTCT
Anolis_olssoni ACTTATTTTTTTAACCATAAACAACCTAAACCCAACAATTTTACTTCTCCTTGGACTTCT
Anolis_coelesti ATTAATTTATCTAACTATAAATAATCTTTCCTCAGCAATTCTTCTCTCACTAGGACTAGT
Anolis_cristate ACTTATCTACATATGTACAAATAATCTTCCATCAGTAATTTTATTAATACTAGGCATTAT
Anolis_evermann ATTAATTTTTTTAACTGTGGCCAACCTTCCACCTATAATTTTATTAACCTTAGGATTTTT
Anolis_pulchell ACTAATCTTTTTAACCATTAATAATCTTCCACCTATAATTTTACTCACACTAGGAATTTT
############################################################
490 500 510 520 530 540
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca ATCTGCCATCATTGGGGGCTGAGGCGGACTAAACCAGACCCAAACACGAAAAATCATAGC
Anolis_occultus ATCTACAATAATCGGGGGTTGAGGAGGCCTAAACCAAACACAAACCCGAAAAATTATAGC
Anolis_sheplani GTCTTCAATAATTGGGGGCTGAGGGGGCTTAAACCAAACACAAGTACGAAAAATTATAGC
Anolis_cybotes TTCCACAACAATCGGAGGTTGGGCGGGACTTAACCAGACACAGACTCGAAAAATTATAGC
Anolis_olssoni ATCTTCTACAGTAGGAGGATGAGCCGGATTAAACCAAACACAAACCCGAAAAATTATAGC
Anolis_coelesti TTCATCCATGGTTGGAGGATGGGGCGGACTAAACCAAACACAAACCCGAAAGATCATAGC
Anolis_cristate CTCCTCCACTGTCGGGGGGTGGTCTGGATTAAACCAAACACAAACTCGAAAAATCATAGC
Anolis_evermann TTCCTCTATTATTGGAGGATGAGGCGGACTAAACCAAACACAAACCCGAAAAATTATAGC
Anolis_pulchell TTCTTCTATTGTAGGAGGATGGGGAGGATTAAACCAAACACAAACTCGAAAAATCATAGC
############################################################
550 560 570 580 590 600
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca ATACTCATCCATCGCACACCTAGGCTGAATGGCAATCATCACCCCACTAATAACTAACCT
Anolis_occultus ATACTCATCAATTGCACACTTGGGTTGAATGGCCGTAATTTCCACCCTAATAACAAACAT
Anolis_sheplani ATACTCATCAATTGCCCACCTAGGGTGGATAGCCTCCGTTTCCTCAATTATAACAAACCT
Anolis_cybotes ATACTCATCTATTGCCCACTTAGGATGAATGGCTACAATTGCCTCAATCATAACAAATAT
Anolis_olssoni CTATTCATCAATTTCACACTTAGGCTGAATGGCCGCAATCTCCTCTATTATAACTAATAT
Anolis_coelesti ATATTCATCAATTGCACATCTCGGATGAATGGCCTCAATCTCCTCCATTATAACTAATAT
Anolis_cristate ATACTCATCAATTGCACACCTTGGATGAATGGCTATAATCGCCTCAATTATAACAAACAT
Anolis_evermann ATATTCATCAATCGCACACCTTGGATGAATGACTGTAATTTCCTCAATCATAACAAACAT
Anolis_pulchell ATATTCATCAATTGCACACCTAGGATGAATAACCGCTATTGCCTCAATCATAACAAACAT
############################################################
610 620 630 640 650 660
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca ACTCATTTTAAACCTAATCATATATCTACTTATAACGACATCAACATTCTTAACCCTTAC
Anolis_occultus CTTTATTATAAACCTAATTATGTATCTAATTATAACAACAACCGCATTCTGGGCCCTAAT
Anolis_sheplani TTTAATCATAAACCTGGTAATTTATATTATTGTAACAACATCCACCTTCTTCCCCCTAAT
Anolis_cybotes TCTTACCATAAATTTAATTATTTACTTATTACTTACTATAGCCACATTTTACTCCATTAT
Anolis_olssoni TCTTATTATAAACCTAACCCTTTATTTAATTATAACAACAACCATGTTTTATACCCTAAT
Anolis_coelesti TCTTGTTATAAACTTAATACTTTACCTAATTATAACAACATCTGTATTCTACGCCTTGAT
Anolis_cristate CATAATTATAAACCTGGTGATTTATTTAATAATAACAACCACCTTGTTTACCACCCTAAT
Anolis_evermann CATAGTTATTAATCTATTAATTTATTTAATAATAACAACAGCCCTATTTTTAGCCTTAAT
Anolis_pulchell TATAATTATAAACCTAATAGTTTACTTAATTATAACAGCAGCCCTATTTTTCTCACTAAT
############################################################
670 680 690 700 710 720
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca ATTTTCAAAATCAAAAACATTACAAGATATCGCCACACTATGAGCCTTATCTCCTACACT
Anolis_occultus CTGCTTAGAATCTAAAACTGTAAAAGACACAACAACTGCCTGAACAACCTCACCAACCAT
Anolis_sheplani TACTTCCAAATCTAAGACAATTCAAAATATAACTTCAACTTGAACACTCTCCCCCACACT
Anolis_cybotes TGTTACAAAATCAAAAACAATTCAAGATACATCAACAACCTGAACAAATTCACCTTACTT
Anolis_olssoni TTTAACTAAATCCAAAACAATCCAAGACTCAACCCTCACCTGATCACTTTCACCAGTACT
Anolis_coelesti CTTAACAAAGTCTAAAACAATTCAAGATACAACAACCACCTGAACACTCTCCCCAACTTT
Anolis_cristate TTGCTCTAAATCAAAAACAATTCAAGACACAGCAACCACTTGAACAACATCACCAACCCT
Anolis_evermann TTTATCTAAATCAAAAACAATTCAAGATACAACAAACACTTGAACAATATCACCCACTTT
Anolis_pulchell TTATTCTAAATCAAAAACAATTAAAGATACAGCAGCGACTTGAACAATATCACCCATCTT
############################################################
730 740 750 760 770 780
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AATAATTATAACGATACTAGCCCTCCTATCACTAGGAGGACTCCCACCATTGACAGGATT
Anolis_occultus CACTTTAACACTTCTTATTTCCCTCTTATCCCTAGGAGGCCTTCCCCCTCTCTCTGGATT
Anolis_sheplani AATTGTTGTTATAATATTATCCCTCCTGTCCTTAGGGGGCCTGCCCCCTTTAACTGGGTT
Anolis_cybotes AATGATCTTAATAATATTAGCCCTGCTCTCATTAGGGGGCTTACCCCCATTAACAGGATT
Anolis_olssoni AACAATTATTATAATACTAACACTCCTCTCACTAGGAGGACTACCTCCCCTAACCGGATT
Anolis_coelesti AACAATTATCATAATACTCTCACTTCTTTCCCTTGGAGGCTTACCCCCCTTAACTGGATT
Anolis_cristate AACTATCATTACTTTACTTTCTCTTCTGTCACTTGGGGGACTCCCACCTCTTACAGGATT
Anolis_evermann AACCATCACAATAATACTTCTTCTACTATCACTTGGTGGCCTACCTCCACTAACAGGATT
Anolis_pulchell AACTATTACAACAACACTAACTTTACTTTCACTTGGAGGGCTTCCNCCACTAACAGGATT
############################################################
790 800 810 820 830 840
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca TATTCCAAAGTGACTTGTCTTACAAGAACTAACAACACAAAACATAACTATAATAGCCAC
Anolis_occultus CTTACCAAAATGACTAATCCTAGAAGAACTTACAAACCAAAATCTACTACCATTAACCAC
Anolis_sheplani TATTCCAAAGTGACTTATTATGGAAGAACTAATTCTACAAAACTTTAACCTATTTACCAC
Anolis_cybotes TATCCCAAAATGATTAATTCTAGAACAACTAACAGCCCAAAACCTAACTACACTAGCTCT
Anolis_olssoni TTTACCAAAATGAATAATCCTAGAAGAACTTACTACCCAAAACCTAACCCCACTGGCCAC
Anolis_coelesti TACACCAAAATGACTTATCTTAGAAGAACTAACTACCCAAAATCTACTCCCCTTAGCCAC
Anolis_cristate TTTACCAAAATGACTAGTTTTAGAAGAAATAATTGTACAAAACTTAACCCCACTCGCCAC
Anolis_evermann TTTGCCAAAATGACTAATTCTAGAAGAATTAACAACCCAAAACCTTATACCACTAGCAAC
Anolis_pulchell TTTACCAAAATGACTTATTCTAGAAGAACTAGTTATACAAAACCTTATTCCACTAGCCAC
############################################################
850 860 870 880 890 900
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca TATCATAGCACTATCAGCCCTCCTTAGCCTCTTCTTCTACTTACGCCTAACATACATTAT
Anolis_occultus CACTATAGCAGTCTCCTCCCTGCTAAGCCTGTTTTTTTACCTACGACTTACCTATAATAC
Anolis_sheplani TATAATAGCCCTGTCATCTTTATTAGGCCTCTTCTTTTACCTACGAATAGTCTACTTAAC
Anolis_cybotes TTTTATAACAATGACAGCTCTCCTTAGCTTATTTTTTTACTTACGCCTAACCTACACTAC
Anolis_olssoni CATAATAGCCATTTCAGCTTTACTAAGCCTATTTTTTTACCTACGCCTAACTTATACAAC
Anolis_coelesti TACTATAGCAATATCCGCCCTACTCAGCCTGTTTTTCTACTTACGTTTAACCTATACCAC
Anolis_cristate AACCATAGCAATTTCCGCCCTTCTTAGTCTATTCTTCTATCTACGCCTAACCTACACCAC
Anolis_evermann AATTATAGCACTAGCCGCCCTCCTCAGCTTATTCTTTTACTTACGCCTAGCTTATACTAC
Anolis_pulchell TACCCTGGCAATATCTGCTCTTCTTAGCCTATTTTTTTACTTACGATTAACCTATACAAC
############################################################
910 920 930 940 950 960
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AACCCTAACCACCCCACCAAACACAACAACATTCAAGCACAAATGACGATTTAATTACAC
Anolis_occultus AACACTAACAATAGCCCCAAACACAATACAAACAAAATTCAAGTGACGATTTAAACCTA-
Anolis_sheplani TACACTTACACTTTCCCCAAACGTGGCCCAAACAAAATTCAAATGACGATTTTATCCAAA
Anolis_cybotes AACACTTACACTTTCCCCAAACACTATACAAACCAAATTTAAATGACGATTTAAACTTAA
Anolis_olssoni AACCTTAACACTCTCCCCAAACACAATACAAACAAAACTCAAATGGCGATTTAAATTAAA
Anolis_coelesti AACCCTCACATTTTCCCCAAACACCATACAAACAAAATTTAAATGACGATTTAAACCAA-
Anolis_cristate AACACTAACATTAGCTCCAAACACCCTACAAATAAACTTTAAATGACGGTTTAAACCAA-
Anolis_evermann AACCTTAACACTTTCTCCAAATACACTACAAATAAAATTTAAATGACGATTTAAACCAA-
Anolis_pulchell CACACTTACACTTTCACCAAACACCCTACAAATAAAATTTAAATGACGATTTAAACCAA-
###########################################################
970 980 990 1000 1010 1020
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AAATAATACTAATCCACTGTCTATCACTCTAACCATG------TCAATTCTACTACTGCC
Anolis_occultus -----ATAACCCACCCTTATTATTAACAGCTACTGCCCCACTAACCACTCTACTACTCCC
Anolis_sheplani TACGACAACCAACTTTTTCTCAGCATTTTTCTTAATT------TCTACCCTTCTTCTTCC
Anolis_cybotes TACAACAACCCCCCCAATGTCTACAACCCTAACAATA------GCAATTTTTTTACTCCC
Anolis_olssoni TAAACCAACAACACTTATACTAATAACTTCTACAATT------ACCACCTTCTTACTCCC
Anolis_coelesti -----CTAATTTAACAACACCACTAACACTTACAACACCTCTAACCGTCCTCTTACTTCC
Anolis_cristate -----CCACATCATTTATTCTAATAACCCTTTCAACT---ATGACCATTTTTTTACTACC
Anolis_evermann -----CCACCCCGCCCCAACTAATAATACTTTCAACA---CTAACTATCTTTCTTTTACC
Anolis_pulchell -----CCACTACATTTTTTCTAATAATTTTTTCTACA---GCGACTATTTTTTTATTACC
############################### #################
1030 1040 1050 1060 1070 1080
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AATTACACCTTTAATTCTGATATAG-GGACTTAGGATAATA-TTAAACCAAGGGCCTTCA
Anolis_occultus GCTTACACCTCTTATATTAATATAG-AAACTTAGATTTAAA--CAAACCAAGAGCCTTCA
Anolis_sheplani CCTCACACCACTAATTTTAATATAA-AAACTTAGGATAAA---TAAACCAAGAGCCTTCA
Anolis_cybotes ACTTATACCAACATTAATACTTTAA-AAACTTAGGATAAAA--CAAACCAAAAGCCTTCA
Anolis_olssoni CCTATCACCACTCATTTTAATATAA-AAACTTAGGTTTAAC--CAAACCAAGAGCCTTCA
Anolis_coelesti CTTAGTCCCACTAATTATATTATAAGAAATTTAGGATAACA-TTAAACCAAGAGCCTTCA
Anolis_cristate TCTCATACCACTAACCCTTATATAA-AAACTTAGGATAACA--TAAACCAAGAACCTTCA
Anolis_evermann CTTAACACCACTAATTTTGTTATAA-AAACTTAGGATAATG-TTAAACCAAGAACCTTCA
Anolis_pulchell TCTTACGCCCCTAATTTTATTATAA-AAACTTAGGATAATTCTTAAACCAAGAGCCTTCA
######################### ############# #################
1090 1100 1110 1120 1130 1140
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AAGCCCAAAACAGGAGTGAAACCCCCCTAGCCCCTGATAAGACTTGTGATATTCTAAAAC
Anolis_occultus AAGCTCAAAATATGGGTGTAACCCCCATAGTTTCTG-TAACACTTACAAAACTTTAATTT
Anolis_sheplani AAGCTCAAAACATGGGTAAAACCCCCATAGTTTTTG-TAAGACCTGTACTATACTATTAT
Anolis_cybotes AAGCTTGAAATAAGGGTGCAACCCCCCTAGTTTTTG-TAAAACTTGCATTATACTATAAT
Anolis_olssoni AAGCTCAAAATAAGGGTCAAACACCCTTAGTTTTTG-TAAGACTTGTGAAATACTAATAC
Anolis_coelesti AAGCTCAAAATACGGGTGAAACCCCCATAATTTCTG-TAAGACCTGTGAAATACTAATTC
Anolis_cristate AAGTTCAGAATAAGGGTGTAAACCCCTTAGTTTTTG-CAAGACTTGTAAAACATTAATTT
Anolis_evermann AAGTTCAAAATAAGGGTGTAACTCCCTTAGTTTTTG-TAAGACTTGTAAAATACTAATCT
Anolis_pulchell AAGCTCAAAATGAGGGTTAAAACCCCTTAGTTTTTG-TAAGACTTGTGAAATACTAATTC
#################################### #######################
1150 1160 1170 1180 1190 1200
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca ACATCTTCTGAATGCAACTCAAACACTTTAATTAAGCTAAAGCCTC-CAGAATAGGTGGG
Anolis_occultus ACATCTTTTGATTGCAACTCAAACACTTTTATTAAGCTAAAGCCTCCTTGAATAGTCGGG
Anolis_sheplani ACATCTCCTGAATGCAACTCAAGCACTTTAATTAAGCTAAAGCCTCTCTAAGTAGGCGGG
Anolis_cybotes GCATCTCCTGAATGCAACTCAAGCACTTTAATTAAGCTAAAGCTTTACTGAATGGGCGGG
Anolis_olssoni ACATCTTCTGAATGCAACTCAAACACTTTAATTAAGCTAAAGCCTCTCTGAATAGGCGGG
Anolis_coelesti ACATCTCATGAATGCAACTCAAGCACTTTTATTAAGCTAAAGCCTTTCTGAATAGGCGGG
Anolis_cristate ACATCTCATGAATGCAACTCAAGCGCTTTTATTAAGCTAAAGCCTCTCTGAATAGGCGGG
Anolis_evermann ACATCTCATGAATGCAACTCAAGCGCTTTTATTAAACTAAAGCCTCCCTGAATAGGCGGG
Anolis_pulchell ACATCTCATGAATGCAACTCAAGCACTTTTATTAAGCTAAAGCCTCCCTGAATAGGCGGG
############################################## #############
1210 1220 1230 1240 1250 1260
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca CCTCGATCCCA-CAACACACTAGTTAACAGCTAATTATCCAATCCAGCGGACTTCTACTC
Anolis_occultus CTTCGATCCCA-CGACAAATTAATTAACAGCTAACTGCCCAAACCAGCGGGCTTCTACTC
Anolis_sheplani CTTTGATCCCG-CGACAAATTAATTAACAGCTAACTACCCAAACCAGCGGGCTTCTACTT
Anolis_cybotes CCTCGATCCCG-CGATAAATTAATTAACAGCTAACTGCCCAAACCAGCGGGCTTCAATTC
Anolis_olssoni CCTCGATCCCG-CGACAAATTAATTAACAGCTAACTACCCAAACCAGCGGGCTTCTACTC
Anolis_coelesti CCTCGAGCCCA-CGACAAATTAGTTAACAGCTAATTACCCAAACCAGCGGGCTTCTATTC
Anolis_cristate CCTTGATCCCA-CGATAAATTAATTAACAGCTAATTACCCAAACCAGCGGGCTTCTATTC
Anolis_evermann CCTTGATCCCA-CGACAAATTAATTAACAGCTAACTACCCTAACCAGCGGGCTTCTATTC
Anolis_pulchell CCTCGATCCCACCGACAAATTAATTAACAGCTAACTGCCCTAACCAGCGGGCTTCTATTC
########### ################################################
1270 1280 1290 1300 1310 1320
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AGCTTCTCCCGTC--TGGGAAAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCTTAAAGGGCTCATCCTT
Anolis_occultus -GCTTCTCCCGTC-GTGGGGGAGACGGGAGAAGCCCCGGAGCCTTTTGGGGCTCCTTTTC
Anolis_sheplani -GCTTCTCCCGTTAGTGAAGGGAACGGGAGAAGCCCCGGAGCC-TTTATGGCTCTTTTTC
Anolis_cybotes -GCTTCTCCCGTTGGTGTAGGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCTTTTAGGGCTCTTCTTT
Anolis_olssoni -GCTTCTCCCGTTGGTA-AGGGAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCGTTTGGGGCTCTTCTTC
Anolis_coelesti -GCTTCTCCCGTCGGT--AAGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCCTTTAGGGCTCTTCTTC
Anolis_cristate -GCTTCTCCCGTCGGTTGGGGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCAATAAGGGCTCGCTTTC
Anolis_evermann -GCTTCTCCCGTTGGTT-GGGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCCATTAGGGCTCTTCTTC
Anolis_pulchell -GCTTCTCCCGTTGGTT-GGGAAACGGGAGAAGCCCCGGAGCCCTTTAGGGCTCATCTTC
############ ######################### ################
1330 1340 1350 1360 1370 1380
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca AAACTTGCATTTTAATGTGTTGCTTACACTACGGGGCT--TGGTGAAGAGAGGAATTAAA
Anolis_occultus AAACTTGCATTTTGACGTG-AAAA--CACTTCGAGACTT-TAATAAGGAAAGGAATCAAA
Anolis_sheplani AAACTTGCATTTTGACGAG-AAAC--CACTACAGGGCTC-TGATAAAGAAAGGAGTTAAA
Anolis_cybotes AAACTTGCATTTTAATGTGAAA----CACTTCGGGACTT-TGATAGAGAGAGGAATTAAA
Anolis_olssoni AAACTTGCATTTTGATGTGAAA----CACTTCGGGACTT-TGATAAAGAAAGGAATTAAA
Anolis_coelesti AAACTTGCATTTTGATGTGGAA----CACCCCAGGACT--TGATGAGGAAGGGAATTAAA
Anolis_cristate AAACTTGCATTTTGACGTG-AAAT--CACTACAGGACTCGTAGTAAAGAAAGGGTTTAAA
Anolis_evermann AAACTTGCATTTTGACGTG-AAAC--CACTACAGAGCTTTTAGTAAAGAAAGGAGTTTAA
Anolis_pulchell AAACTTGCATTTTGACGTGTAAAC--CACTACTGAGGCTCTGATAAAGAAAGGTTTTAAA
################### ############ ####################
1390 1400 1410 1420 1430 1440
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
Leiocephalus_ca CCTCCATGAATAGGTCTACAGCCTACCGTCTAAACACTCGACCACTTTACCTGTGTTCAT
Anolis_occultus CCCCTGTAAATAGGACTACAGCCTACCGCCT-AACACTCGGCCACCTTACCTGTGTCTAT
Anolis_sheplani CCAATGTTAGCAGGACTACAGCCTGCCGCCT-TACACTCGGCCACTTTACCTGTGTTTAT
Anolis_cybotes CCAGTGTAAATAGGACTACAGCCTACCGCCT-AACATTCGGCCACTCTACCTGTGTTCAT
Anolis_olssoni CCAATGTTAATAGGACTACAGCCTACTGCCT-ATCATTCGGCCACTTTACCTGTGTTCAT
Anolis_coelesti CCCCTGTTAATGAGTCTACAGCTCACCGCCT-AACACTCGGCCACCTTACCTGTGTCCAT
Anolis_cristate CCAATATAAATAGATTTACAATCTACCGCCT-AATAGTCAGCCACTTTACCTGTGTCCAT
Anolis_evermann CCAATGTAAGTAAGTTTACAGCTTACCGCCT-AACACTCGGCCACTTTACCTGTGTTTAT
Anolis_pulchell CCTCTGTAAATAGATTTACAGCCTACCGCCT-AATACTCGGCCACTTTACCTGTGTCTAT
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1450 1460
=========+=========+==
Leiocephalus_ca TACCCGTTGACTATTTTCAACC
Anolis_occultus TAATCGTTGA------------
Anolis_sheplani TACCCGTTGA------------
Anolis_cybotes TAATCGTTGATTTTTCTCAACT
Anolis_olssoni TAATCGTTGA------------
Anolis_coelesti CAATCGTTGA------------
Anolis_cristate TAAGCGTTGA------------
Anolis_evermann TAATCGTTGA------------
Anolis_pulchell TAATCGTTGA------------
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Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 5 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 8 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 8 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None
Flank positions of the 14 selected block(s) Flanks: [60 959] [966 996] [1004 1045] [1047 1059] [1064 1116] [1118 1186] [1188 1211] [1213 1260] [1262 1273] [1279 1303] [1305 1339] [1347 1358] [1361 1411] [1413 1450] New number of positions in input.fasta-gb: 1353 (92% of the original 1462 positions)