Processed file: input.fasta
Number of sequences: 5
Alignment assumed to be: Protein
New number of positions: 564 (selected positions are underlined in blue)
10 20 30 40 50 60
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
NP_957219.2_dou MAQVKVQTSAPLSGPGLTAVAPAVAMPSPGALSLQPTINGTVPATTPTCPSPASGFVDST
NP_001376318.2 MAQVKMQTTANLSVPPMSPMVLPLPVTAANTLGLPSAMNGSIPESAASCSSPTAGLADPA
NP_079579.2_dou ------------------------------------------------------------
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NP_001157852.1 ------------------------------------------------------------
70 80 90 100 110 120
=========+=========+=========+=========+=========+=========+
NP_957219.2_dou VPASPSGPPQENMANPKEKTPMCLVNELARFNRIQPQYKLLNEKGPAHAKIFTVQLCLGN
NP_001376318.2 PSSNPPAPLQDNMANPKEKTPMCLVNELARFNRIQPQYKLLNERGPAHAKMFTVQLTLGE
NP_079579.2_dou ------------MANPKEKTPVCLVNELARFHSIQPQYKLLNESGPAHSKMFSVQLSLGE
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NP_001157852.1 ------------MANPKEKTAMCLVNELARFNRVQPQYKLLNERGPAHSKMFSVQLSLGE
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130 140 150 160 170 180
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190 200 210 220 230 240
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250 260 270 280 290 300
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310 320 330 340 350 360
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############################################################
370 380 390 400 410 420
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430 440 450 460 470 480
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490 500 510 520 530 540
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NP_001376318.2 PKGILHLSPDVYQEMEASRNKSAPGTTVSYLSPKEMSQTSSSFFSISPTTNSTATIAREL
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############################################# ##############
550 560 570 580 590 600
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NP_957219.2_dou LLSGTSPTAEALVLKGKAPALACGSIQPSQQLEYLAHIQGFQVQYSDRQTDKEFMTYLTL
NP_001376318.2 LMNGTSPTAEAIGLKGISPASPCSAVQPSKQLEYLARIQGFQVHYSDRQNGKECMTCLTL
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NP_001157852.1 LMNGTSSTAEAIGLKGSSPTPPCSPVQPSKQLEYLARIQGF-------------------
#########################################
610 620 630 640 650 660
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NP_957219.2_dou SPVQMTFHGIGSSIPASHDQAALSALKQLSEQGLDPVDGPIKVENGSCDIQAKRLAERTE
NP_001376318.2 SPVQMTFQGIGSSIEASHDQAALSALKQFSEQGLDPVEGAMKVENGSLEKQVKHLGEKAD
NP_079579.2_dou -------------------QAALSALKQFSEQGLESIDGAVNVEKGSLEKQAKHLREKAD
XP_059749083.1 APVQTTFHAIGSSTEASHDQAALSALKQFSEQGLDSMEGAMNIEKGSLEKQAQHLGEKAN
NP_001157852.1 -------------------QAALSALKQFSEQGLDPIDGAMNIEKGSLEKQAKHLREKAD
#########################################
670 680
=========+=========+
NP_957219.2_dou SKPTNSGTTAQDCKDSKAVV
NP_001376318.2 NKQTNSGTIAQDCKDSKAVV
NP_079579.2_dou NNQAKPASISQDCKKSKSAI
XP_059749083.1 NNQTHPGSIAQDCKKSRSV-
NP_001157852.1 NNQAPPGSIAQDCKKSNSAV
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Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 3 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 4 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 8 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: None Use Similarity Matrices: Yes
Flank positions of the 4 selected block(s) Flanks: [73 460] [462 525] [527 581] [620 676] New number of positions in input.fasta-gb: 564 (82% of the original 680 positions)